拡張子がMTSという事であれば、AVCHD形式の可能性が高いです。
拡張子ってあまり意味がないので、撮影したカメラかcodecを記載する方が適切な情報をもらえると思いますよ。
最終的にBDMV用にするという前提だとすると、書き出しプリセットからH264. Blu-rayを選択するのが適切でしょう。
ただし、当然BDMV用にオーサリングする必要があります。
AVCHD（H.264/AVC）からH.264に変換するので、まったく同じものが作成できるわけでもありませんが目に見えるほど変化はないと思います。
